基于特征的深度学习预测化合物-蛋白质相互作用的研究进展

药物研发过程中,化合物-蛋白质相互作用（compound-protein interaction,CPI）预测是发现苗头化合物、药物重定位等研究的关键技术手段。近年来,深度学习被广泛应用于CPI研究,加速了药物发现中CPI预测的发展。本文重点讨论基于特征的 CPI 预测模型,首先,介绍了CPI预测中常见的数据库、化合物和蛋白质的典型特征表示方法。根据建模中的关键问题,从多模态和注意力机制两个方面,对基于特征的CPI预测模型展开论述。在此基础上,选取其中12个模型,在3个经典数据集上评估了模型在分类任务和回归任务中的性能。本文总结当前该领域面临的挑战,对未来的发展方向进行展望,为CPI预测方法进一步研究提供思路。     

高校学生闲暇生活引导与教育研究

闲暇时间已成为大学生生活的重要组成部分。如果缺乏合理的引导,学生的一些消极行为将对其自身成长产生负面影响。因而,引导和教育大学生如何高质量地度过闲暇生活,已成为高校学生管理工作中的当务之急。     

基于多向药理学的BET Bromodomain抑制剂及降解剂研究进展

溴结构域和末端外结构域(BET)Bromodomain已成为可用于治疗癌症和其他人类疾病的新靶标.目前已发现了几类有效的选择性小分子BET Bromodomain抑制剂,且多种已处于临床开发中.临床前和临床数据已证明BET Bromodomain抑制剂有良好的前景,但也存在耐药性等潜在缺陷.目前人们正在尝试将具有不同作用机制的靶标与BET Bromodomain组合,开发基于多向药理学的BET Bromodomain抑制剂及降解剂.本文综述了激酶/BET小分子抑制剂、组蛋白去乙酰化酶/BET小分子抑制剂及BET蛋白降解剂,为后续针对BET蛋白更深入的研究提供思路.     

基于中药网络药理学探讨白癜风胶囊治疗白癜风的作用机制

目的： 基于中药网络药理学探讨中药制剂白癜风胶囊治疗白癜风的物质基础和作用机制。方法： 通过数据库检索、药代动力学参数筛选、文献挖掘、靶点预测技术搜集白癜风胶囊治疗白癜风的活性化合物及作用靶标。Cytoscape软件构建"中药-化合物-靶标"网络图,并进行拓扑分析探索关键活性成分。STRING数据库探索潜在治疗靶标的蛋白质相互作用,分析核心靶标。DAVID在线富集分析平台对潜在治疗靶标进行基因本体（GO）和生物途径（KEGG）功能富集。结果： 白癜风胶囊中共收集133种活性化合物和693个潜在靶标,其中白癜风治疗靶标85个。网络分析结果显示槲皮素,木犀草素,β-谷固醇,叶酸,山奈酚,紫草素,黄芩素,亚叶酸,异鼠李素,异牡荆素是其重要的活性成分。DAVID平台共富集到99条KEGG通路,144条生物过程,19种细胞组分以及27种分子功能。结论： 白癜风胶囊通过炎症反应、T细胞增殖的正调控、凋亡过程的负调控、免疫反应等生物过程发挥疗效,并涉及ATP结合、氧化还原酶活性、非跨膜蛋白酪氨酸激酶活性等分子功能,且与PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、Toll样受体信号通路、酪氨酸代谢、Jak-STAT信号通路、细胞凋亡、NOD样受体信号通路、黑色素生成、苯丙氨酸代谢、NF-κB等信号通路密切相关。     

基于深度学习的结直肠癌全视野数字病理切片分子分型识别研究

  目的  建立人工智能辅助结直肠癌病理切片分子分型诊断系统。  方法  在癌症基因组图谱（the cancer genome Atlas, TCGA）数据库中筛选出422例结直肠癌患者的812张病理切片,分为训练集（75%）和测试集（25%）;存入www.paiwsit.com数据库中,根据资深的病理医生标注的数据进行处理及分割,得到超过400万张带有标签的训练集,最后利用深度学习模型进行训练。  结果  在经过多种卷积神经网络模型训练后,在110例203张切片的测试集上测试,子图级别达到53.04%的准确率,切片级别准确率达到51.72%,其中结直肠癌共识分子亚型之一的经典型（CMS2）切片级准确率达到75.00%。  结论  本研究对促进结直肠癌筛查和精准治疗具有重要意义。     

文本挖掘技术在药物研究中的应用

介绍生物医学文献中文本挖掘的过程,重点分析论述文本挖掘在药物研究中的应用,主要包括在药物命名识别、药物靶标发现、药物疗效评价和中医用药规律中的应用,最后指出文本挖掘在生物医学知识发现中需要解决的问题,并展望文本挖掘在药物研究领域的发展前景.     

TAF1蛋白及其抑制剂研究进展

TATA框结合蛋白关联因子1(TAF1)蛋白是转录因子ⅡD的主要成分,通过其溴结合域（bromodomain）识别乙酰化的赖氨酸残基,结合到核心启动子序列上,最终启动转录。该文综述了TATA框结合蛋白关联因子1蛋白的结构及其识别和结合乙酰化赖氨酸的机制,讨论了TATA框结合蛋白关联因子1蛋白在基因转录、细胞增殖、细胞损伤修复以及肌张力障碍性神经系统疾病、肿瘤中的相关生物学作用,并总结了TATA框结合蛋白关联因子1（2）bromodomain 抑制剂的研究进展。     

衍生化HPLC/MS法测定有机羧酸物质的研究进展

利用高效液相色谱-质谱联用 (HPLC/MS) 法对体液中微量的羧酸化合物进行定量检测仍然是一个难题。近年的研究显示采用衍生化质谱增敏法成为解决这一问题的重要方法。本文综述了近年来应用此类方法测定微量羧酸物质的研究,并对研究中所采用的衍生化试剂和化学反应进行了总结。     

盐酸利多卡因注射剂遗传毒性杂质研究

确定2,6-二甲基苯胺为盐酸利多卡因注射液中遗传毒性杂质,N-氯乙酰-2,6-二甲基苯胺为潜在遗传毒性杂质,建立LC-MS/MS方法,用色谱柱Agilent ZORBAX Eclipse Plus C₁₈（4.6 mm 250 mm,5 μm）对原料、自制制剂及原研制剂进行遗传毒性杂质研究。研究结果表明自制制剂中杂质2,6-二甲基苯胺与N-氯乙酰-2,6-二甲基苯胺除由原料引入外,可能分别由氧化条件或碱性条件下降解引入,为盐酸利多卡因注射液的遗传毒性风险评估和工艺优化提供参考与指导。     

基于MOOS理念的药学网络学习平台的构建

为充分运用互联网技术培养大学生的创新能力,在对“幕课”MOOC（Masive Open Orlline Comes）网络教学理念的研究基础上,通过对网络学习模式进行更广泛的探索,提出“慕斯”（Mofie Open Onhnesch曲l,即移动在线开放校园,简称MOOS）网络教学新理念,突破单一的课程学习模式,实现网络学习的横向拓展,构建以现代大学生需求为驱动的网络学习生态系统。该文探讨基于MOOS理念构建药学网络学习平台,以期提高药学生的创新思维与能力。